Skip to main content

Advertisement

Table 2 Empirical type I error rates and power of the proposed bootstrap-based (BS) test versus the dynamic correlation (DC) and cross-correlation function (CCF) to detect pairwise dependency under the dependency Pattern II. The power refers to the probability of detecting the interaction when the interaction really exists.

From: Transition Dependency: A Gene-Gene Interaction Measure for Times Series Microarray Data

   
Replicates Time points    DC CCF   DC CCF
2 7 0.00 0.084 0.057 0.038 0.076 0.038 0.032
   0.05 0.077 0.048 0.036 0.066 0.051 0.042
   0.10 0.078 0.053 0.045 0.095 0.059 0.041
   0.15 0.125 0.046 0.038 0.122 0.044 0.038
2 10 0.00 0.059 0.053 0.047 0.058 0.033 0.039
   0.05 0.087 0.050 0.040 0.063 0.039 0.043
   0.10 0.086 0.047 0.032 0.102 0.043 0.040
   0.15 0.152 0.049 0.039 0.157 0.048 0.037
3 7 0.00 0.059 0.052 0.028 0.074 0.045 0.040
   0.05 0.085 0.048 0.045 0.070 0.049 0.042
   0.10 0.106 0.057 0.052 0.099 0.052 0.040
   0.15 0.137 0.037 0.031 0.137 0.053 0.041
3 10 0.00 0.049 0.054 0.041 0.045 0.041 0.045
   0.05 0.081 0.050 0.042 0.051 0.047 0.043
   0.10 0.116 0.048 0.037 0.126 0.040 0.032
   0.15 0.222 0.045 0.036 0.217 0.043 0.051
5 7 0.00 0.065 0.049 0.035 0.059 0.056 0.050
   0.05 0.073 0.055 0.044 0.071 0.057 0.051
   0.10 0.131 0.058 0.044 0.114 0.050 0.043
   0.15 0.203 0.053 0.052 0.239 0.049 0.039
5 10 0.00 0.042 0.049 0.048 0.052 0.049 0.047
   0.05 0.094 0.058 0.058 0.064 0.045 0.040
   0.10 0.186 0.044 0.054 0.181 0.041 0.049
   0.15 0.475 0.058 0.042 0.516 0.060 0.054
  1. The symbol denotes the number of bootstrap samples generated for each gene. The symbol denotes the deviation parameter.