Skip to main content

Advertisement

Table 2 MINET results: noise stands for Gaussian additive noise, NA for missing values, eqf for equal frequency, and eqw for equal width In bold face maximum -scores and significantly not different values.

From: On the Impact of Entropy Estimation on Transcriptional Regulatory Network Inference Based on Mutual Information

Method MRnet
Estimator No noise, no NA Noise, no NA No noise, NA Noise, NA
Pearson 0.2006 0.1691 0.1790 0.1611
Spearman 0.3230 0.1771 0.1464 0.1333
Emp eqf 0.3420 0.1551 0.1136 0.0868
Emp eqw 0.2028 0.1650 0.1036 0.0822
MM eqf 0.3396 0.1524 0.1140 0.0924
MM eqw 0.1909 0.1592 0.1068 0.0883
Shr eqf 0.3306 0.1506 0.1150 0.0788
Shr eqw 0.1935 0.1574 0.1090 0.0839
   Aracne
Pearson 0.1117 0.1082 0.1054 0.1069
Spearman 0.1767 0.1156 0.1167 0.1074
Emp eqf 0.1781 0.1042 0.0993 0.0765
Emp eqw 0.1287 0.1082 0.0892 0.0727
MM eqf 0.1786 0.1032 0.0985 0.0783
MM eqw 0.1217 0.1049 0.0931 0.0767
Shr eqf 0.1736 0.1000 0.1009 0.0697
Shr eqw 0.1152 0.1045 0.0898 0.0717
   CLR
Pearson 0.2242 0.1941 0.2231 0.1911
Spearman 0.2197 0.1915 0.1806 0.1582
Emp eqf 0.2123 0.1729 0.1847 0.1397
Emp eqw 0.2098 0.1724 0.1799 0.1327
MM eqf 0.2128 0.1729 0.1860 0.1427
MM eqw 0.2083 0.1723 0.1845 0.1384
Shr eqf 0.2096 0.1670 0.1864 0.1311
Shr eqw 0.2030 0.1659 0.1822 0.1333