Skip to main content

Advertisement

Table 3 Expected classification error of selected experiments for prostate cancer protein-abundance data under two different features selection methods (t-test and RELIEF) for p = 2.

From: Is Bagging Effective in the Classification of Small-Sample Genomic and Proteomic Data?

Rule FS Single
DLDA t-test 20 0.188 0.211 0.199 0.196 0.194 0.194 0.193 0.192 0.191 0.191 0.191
DLDA t-test 40 0.187 0.207 0.196 0.194 0.192 0.191 0.191 0.191 0.190 0.190 0.189
DLDA RELIEF 20 0.468 0.523 0.492 0.484 0.477 0.475 0.471 0.472 0.469 0.467 0.466
DLDA RELIEF 40 0.458 0.502 0.477 0.474 0.465 0.469 0.465 0.463 0.462 0.463 0.460
LDA t-test 20 0.212 0.241 0.225 0.222 0.219 0.218 0.216 0.216 0.215 0.215 0.215
LDA t-test 40 0.198 0.224 0.210 0.208 0.205 0.204 0.203 0.202 0.202 0.202 0.201
LDA RELIEF 20 0.422 0.492 0.449 0.435 0.426 0.426 0.422 0.419 0.417 0.415 0.410
LDA RELIEF 40 0.416 0.479 0.440 0.433 0.426 0.421 0.420 0.418 0.416 0.415 0.413
3NN t-test 20 0.187 0.251 0.203 0.195 0.192 0.189 0.187 0.187 0.186 0.185 0.185
3NN t-test 40 0.153 0.208 0.168 0.162 0.158 0.156 0.154 0.153 0.152 0.152 0.151
3NN RELIEF 20 0.268 0.355 0.307 0.299 0.287 0.284 0.280 0.278 0.277 0.276 0.275
3NN RELIEF 40 0.222 0.283 0.248 0.239 0.233 0.231 0.229 0.228 0.226 0.226 0.224
CART t-test 20 0.232 0.247 0.223 0.218 0.213 0.210 0.209 0.209 0.208 0.209 0.208
CART t-test 40 0.213 0.219 0.198 0.194 0.189 0.189 0.187 0.185 0.185 0.185 0.184
CART RELIEF 20 0.244 0.284 0.259 0.256 0.251 0.249 0.247 0.245 0.244 0.244 0.243
CART RELIEF 40 0.222 0.250 0.233 0.229 0.226 0.225 0.224 0.223 0.223 0.223 0.221
NNET t-test 20 0.297 0.300 0.271 0.266 0.260 0.259 0.256 0.256 0.254 0.254 0.253
NNET t-test 40 0.277 0.274 0.254 0.248 0.244 0.244 0.240 0.241 0.239 0.239 0.239
NNET RELIEF 20 0.345 0.382 0.337 0.324 0.318 0.314 0.313 0.313 0.312 0.309 0.307
NNET RELIEF 40 0.329 0.348 0.312 0.303 0.295 0.294 0.290 0.290 0.290 0.288 0.289
  1. Bold-face type indicates the values that are smaller for the ensemble classifier as compared to a single classifier at a 99% significance level, according to the one-tailed paired t-test.